中國(guó)科學(xué)院微生物研究所（以下簡(jiǎn)稱微生物所）成立于1958年12月3日，其前身是中國(guó)科學(xué)院應(yīng)用真菌研究所和中國(guó)科學(xué)院北京微生物研究室，目前已發(fā)展成為一個(gè)具有雄厚基礎(chǔ)、強(qiáng)大實(shí)力和廣泛影響的綜合性微生物學(xué)研究和微生物技術(shù)研發(fā)機(jī)構(gòu)。 

 

　　微生物所堅(jiān)持“微生物、高科技、大產(chǎn)業(yè)”的戰(zhàn)略定位，面向工業(yè)升級(jí)、農(nóng)業(yè)發(fā)展、人口健康和環(huán)境保護(hù)等國(guó)家重大需求，瞄準(zhǔn)微生物學(xué)科的發(fā)展前沿，以微生物資源、微生物技術(shù)、病原微生物與免疫為主要研究領(lǐng)域，在研究微生物生物多樣性、基本生命特征和生態(tài)功能的基礎(chǔ)上，努力創(chuàng)建從微生物資源開(kāi)發(fā)、功能改造和利用、生物技術(shù)創(chuàng)新到成果轉(zhuǎn)化的自主研發(fā)體系，創(chuàng)建世界一流的微生物學(xué)研究中心和微生物生物技術(shù)研發(fā)基地。

 

　微生物所設(shè)有微生物資源前期開(kāi)發(fā)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、真菌學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院微生物生理與代謝工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、植物基因組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（與中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所共建）、中國(guó)科學(xué)院病原微生物與免疫學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室五個(gè)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，另設(shè)有技術(shù)轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化中心、微生物資源與大數(shù)據(jù)中心。同時(shí)有依托微生物所建設(shè)中國(guó)科學(xué)院—發(fā)展中國(guó)家科學(xué)院生物技術(shù)卓越中心、中國(guó)科學(xué)院—發(fā)展中國(guó)家科學(xué)院新發(fā)突發(fā)傳染病研究與交流卓越中心和中國(guó)科學(xué)院流感研究與預(yù)警中心。研究所擁有亞洲 很大的、近52萬(wàn)號(hào)標(biāo)本的菌物標(biāo)本館和國(guó)內(nèi) 很大的、保藏了近6.1萬(wàn)株菌的中國(guó)普通微生物菌種保藏管理中心，建有網(wǎng)絡(luò)信息中心、大型儀器中心和生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室、SPF實(shí)驗(yàn)動(dòng)物房等技術(shù)支撐平臺(tái)，擁有一個(gè)藏書（刊）5萬(wàn)余冊(cè)的專業(yè)性圖書館。 

 

　　2018年，微生物所結(jié)合研究所“十三五”戰(zhàn)略規(guī)劃，在社會(huì)可持續(xù)發(fā)展、人類健康、制造業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí)和農(nóng)業(yè)發(fā)展方式轉(zhuǎn)變等領(lǐng)域，繼續(xù)發(fā)揮了微生物生物技術(shù)專長(zhǎng)，創(chuàng)新了一系列微生物生物技術(shù)，一三五規(guī)劃取得重大突破進(jìn)展。其中包括：高附加值化學(xué)品工業(yè)生產(chǎn)菌株的產(chǎn)能提升，高附加值氨基酸及其衍生物的生物合成，流感等動(dòng)物源性新突發(fā)傳染性病原跨種感染、傳播及致病的分子機(jī)制。 

 

　　2018年，微生物所主導(dǎo)了中國(guó)科學(xué)院微生物組計(jì)劃先期實(shí)施，發(fā)揮科技智庫(kù)功能，服務(wù)國(guó)家科技戰(zhàn)略和科技政策的制定。中國(guó)科學(xué)院重點(diǎn)部署項(xiàng)目“人體與環(huán)境健康的微生物組共性技術(shù)研究”暨“中國(guó)科學(xué)院微生物組計(jì)劃”已經(jīng)正式啟動(dòng)。項(xiàng)目將淬煉一支富有國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)力的微生物組研究團(tuán)隊(duì)，凝練出一批先進(jìn)的微生物組研究成果、技術(shù)和方法，為中國(guó)微生物組計(jì)劃的誕生發(fā)揮先導(dǎo)和引領(lǐng)作用，推動(dòng)我國(guó)在全球微生物組研究的競(jìng)爭(zhēng)中實(shí)現(xiàn)從“跟跑到并跑，乃至領(lǐng)跑”。